رئیس‌جمهور در جریان اولین سفر خود به قم در دوره ریاست جمهوری با آیت‌الله العظمی بهجت دیدار کرده بودند .

به گزارش رجانیوز به نقل از یکی از حاضران در آن دیدار، آیت‌الله العظمی بهجت خطاب به دکتر احمدی‌نژاد گفته بودند: خداوند بر حسن حال شما بیفزاید. ببینید خدا از چه راضی است و از چه راضی نیست؟ همیشه در نظر داشته باشید که شاهد، حاکم است.

این مرجع تقلید به نقل از آیت‌الله شاه‌آبادی خاطرنشان کرده بودند: خدا نمی‌تواند که نداند، خدا همه چیز را می‌داند. خدا نمی‌تواند که نتواند، خدا بر همه چیز قادر است. خدا را ناظر بدانید نه فقط در اقوال بلکه در قلوب. از خدا بخواهیم که ما را هلاک نکند، چون اگر ما اهلاک کردیم، خداوند ما را هلاک می‌کند. از خدا بخواهیم که ما را هلاک نکند.خود را مستقل از خدا ندانیم.

این مرجع تقلید در پایان اظهار داشتند: این دعا را مرتب بخوانید: "اللهم اجعلنی فی درعک الحصینة التی تجعل فیها من ترید"